На счет анкеты я бы сказала «заполнено 90%», но это, конечно, не в развернутом предложении, а в тезисном варианте, например, как пометка-объяснение под заглавием или что-то вроде того. Если это часть предложения, то Ваш вариант выглядит вполне пристойно. Просто английский вообще часто звучит лаконичнее, чем русский, тут уж ничего не поделаешь. А по поводу загрузки файла – «выполнено 90%». Ничего более изысканного в голову не приходит.